En avtale var inngått etter at klubbene hadde funnet et kompromiss på en overgangssum, som ville ha vært på minimum 35 millioner pund.
Den 25-åringen hadde fått tillatelse til å fullføre formalitetene knyttet til overgangen, inkludert en medisinsk test, i London på mandag, før han skulle signere en langsiktig kontrakt med Premier League-mesterne.
Det var en travel fristdag for Liverpool, som også ble enige om en britisk rekordavtale på 125 millioner pund med Newcastle for den svenske spissen Alexander Isak.
Les: Erik ten Hag er skikkelig sinna
Men kilder har nå bekreftet overfor BBC Sport at avtalen er avlyst.
Palace nektet å godkjenne overgangen da de støtte på vanskeligheter med å skaffe en erstatning – ettersom målspilleren Igor Julio valgte et trekk til West Ham.
De signerte Toulouse-midtstopperen Jaydee Canvot på overgangsvinduets siste dag, men Palace ønsket å ha to erstatninger på plass før de godkjente Guehis avgang.
Les: Victor Lindelöf har signert og Harvey Elliott og Jadon Sancho finleser detaljer
